Evolution, subcellular distribution, and function of Rcor2
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Date
2022
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Abstract
La familia Correpresores de Rest (Rcor) tiene tres miembros Rcor1, Rcor2 y Rcor3, los cuales se han caracterizado como correpresores transcripcionales. Los miembros de la familia Rcor han sido llamados parálogos por su homología de secuencia pero también por compartir ciertas propiedades bioquímicas. Sin embargo, no se han realizado estudios filogenéticos para establecer su relación evolutiva. En cuanto a sus funciones, todas las proteínas de esta familia regulan la expresión génica mediante la formación de distintos complejos, pero, poco es conocido acerca de otras actividades que puedan realizar. Teniendo en cuenta que la distribución subcelular de cada proteína está estrechamente relacionada con sus funciones, esta tesis se centra en comprender la evolución, distribución subcelular y función de Rcor2, un miembro de la familia Rcor.En el primer capítulo de esta tesis, nos enfocamos en comprender la historia evolutiva de la familia de proteínas Rcor y su interacción con la Desmetilasa Específica de Lisina 1 (LSD1). Descubrimos que los genes Rcor son el resultado de dos rondas de duplicación del genoma completo (WGD) en el ancestro vertebrado, por lo tanto, son genes ohnólogos. También predijimos las secuencias ancestrales de Rcor y LSD1 presentes en los vertebrados mandibulados ancestrales y determinamos que su interacción precede a la diversificación de la familia Rcor.El segundo capítulo abordó la caracterización de la localización subcelular de Rcor2 en células en interfase, enfatizando su distribución en speckles nucleares (NS). Como resultado, identificamos que la distribución de Rcor2 varía según el tipo de célula. En las células neurales, Rcor2 fue predominantemente nuclear, mientras que en las células renales tiene una distribución homogénea. Rcor2 colocaliza e interactúa con SRRM2 (un componente de los NS) en células PC-12, HT22 y N2A. Consistentemente, la sobreexpresión de Rcor2 recapitula la distribución endógena. Respecto a su función en los NS, identificamos que Rcor2 regula su morfología.En el capítulo final de esta tesis, caracterizamos la distribución de Rcor2 y sus isoformas durante el ciclo celular, investigando más a fondo su localización en diferentes estructuras mitóticas. En este sentido, identificamos que Rcor2 se localiza en centrosomas y midbodies durante la mitosis. Además, establecimos que las dos isoformas de Rcor2 difieren en su región C-terminal, en particular, la isoforma 2 carece del dominio SANT2. En cuanto a su distribución, las isoformas sobreexpresadas pueden integrar los polos del huso mitótico y el midbody. No obstante, solo epítopes correspondientes a Rcor2.2 son detectados en el midbody.En conclusión, Rcor2 es una proteína de vertebrados con una distribución subcelular diversa entre líneas celulares y durante el ciclo celular.
Description
Tesis (Doctor of Philosophy in the subject of Biological Sciences with Specialization in Molecular and Cellular Biology)--Pontificia Universidad Católica de Chile, 2022