Relación virus-hospedero en ambientes termales: especificidad y ecogenómica de sistemas CRISPR-Cas
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Date
2023
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Abstract
La relación virus-hospedero se ha estudiado en varios ensayos dentro de los laboratorios, mientras que se han realizado comparativamente pocas descripciones en ambientes naturales. Entre estos, los ambientes de alta temperatura han sido comparativamente menos explorados, a pesar de los reportes de virus habitando en aguas termales y su relación con hospederos específicos. En ambientes termales con temperaturas por debajo de los 80°C y con un pH cercano a 7 todavía son menos los estudios representados en las bases de datos. En esta tesis doctoral se hipotetizó que la relación virus-hospedero es altamente específica dentro de los diferentes hábitats termales (sedimentos, tapete microbiano y agua termal), y que los sistemas de defensa CRISPR-Cas podrían revelar novedades filogenéticas debido a procesos coevolutivos. Mediante análisis bioinformáticos realizados en 48 metagenomas, que incluyen 13 de Chile en El Tatio (tercer campo geotermal más grande del mundo), se identificó una relación virus-hospedero altamente específica para termas de todo el mundo geográficamente distantes y en el rango mesotermofílico (40°-80°C) con pH circumneutral (pH 6-8). Además, se identificaron nuevos grupos de genes conservados del sistema inmunitario adaptativo CRISPR-Cas (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats and CRISPR-Associated Proteins). Finalmente, el análisis más detallado de los sistemas CRISPR-Cas encontrados en los ambientes termales indica una asombrosa diversidad genética, incluidos tipos de sistemas y proteínas raros, que podrían tener un potencial biotecnológico. Este trabajo contribuye a comprender las complejas relaciones virus-hospedero en la naturaleza y refuerza la comprensión de los virus como una de las principales fuerzas impulsoras de la evolución de las comunidades microbianas en ambientes naturales.
Description
Tesis (Doctor en Ciencias Biológicas, mención Genética Molecular y Microbiología)--Pontificia Universidad Católica de Chile, 2023
TESIS EMBARGADA HASTA EL 28 DE MARZO DE 2027
TESIS EMBARGADA HASTA EL 28 DE MARZO DE 2027