Browsing by Author "Verbel Vergara, Daniel Eduardo"

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    Cross-talk between dopamine D1 and corticotropin releasing factor type 2 receptors leads to occlusion of their ERK1/2 signaling
    (2020) Yarur, H. E.; González Bustos, Marcela Paz; Verbel Vergara, Daniel Eduardo; Andrés Coke, María Estela; Gysling Caselli, Katia
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    Evolution, subcellular distribution, and function of Rcor2
    (2022) Verbel Vergara, Daniel Eduardo; Andrés Coke, María Estela; Pontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Ciencias Biológicas
    La familia Correpresores de Rest (Rcor) tiene tres miembros Rcor1, Rcor2 y Rcor3, los cuales se han caracterizado como correpresores transcripcionales. Los miembros de la familia Rcor han sido llamados parálogos por su homología de secuencia pero también por compartir ciertas propiedades bioquímicas. Sin embargo, no se han realizado estudios filogenéticos para establecer su relación evolutiva. En cuanto a sus funciones, todas las proteínas de esta familia regulan la expresión génica mediante la formación de distintos complejos, pero, poco es conocido acerca de otras actividades que puedan realizar. Teniendo en cuenta que la distribución subcelular de cada proteína está estrechamente relacionada con sus funciones, esta tesis se centra en comprender la evolución, distribución subcelular y función de Rcor2, un miembro de la familia Rcor.En el primer capítulo de esta tesis, nos enfocamos en comprender la historia evolutiva de la familia de proteínas Rcor y su interacción con la Desmetilasa Específica de Lisina 1 (LSD1). Descubrimos que los genes Rcor son el resultado de dos rondas de duplicación del genoma completo (WGD) en el ancestro vertebrado, por lo tanto, son genes ohnólogos. También predijimos las secuencias ancestrales de Rcor y LSD1 presentes en los vertebrados mandibulados ancestrales y determinamos que su interacción precede a la diversificación de la familia Rcor.El segundo capítulo abordó la caracterización de la localización subcelular de Rcor2 en células en interfase, enfatizando su distribución en speckles nucleares (NS). Como resultado, identificamos que la distribución de Rcor2 varía según el tipo de célula. En las células neurales, Rcor2 fue predominantemente nuclear, mientras que en las células renales tiene una distribución homogénea. Rcor2 colocaliza e interactúa con SRRM2 (un componente de los NS) en células PC-12, HT22 y N2A. Consistentemente, la sobreexpresión de Rcor2 recapitula la distribución endógena. Respecto a su función en los NS, identificamos que Rcor2 regula su morfología.En el capítulo final de esta tesis, caracterizamos la distribución de Rcor2 y sus isoformas durante el ciclo celular, investigando más a fondo su localización en diferentes estructuras mitóticas. En este sentido, identificamos que Rcor2 se localiza en centrosomas y midbodies durante la mitosis. Además, establecimos que las dos isoformas de Rcor2 difieren en su región C-terminal, en particular, la isoforma 2 carece del dominio SANT2. En cuanto a su distribución, las isoformas sobreexpresadas pueden integrar los polos del huso mitótico y el midbody. No obstante, solo epítopes correspondientes a Rcor2.2 son detectados en el midbody.En conclusión, Rcor2 es una proteína de vertebrados con una distribución subcelular diversa entre líneas celulares y durante el ciclo celular.
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    Revealing RCOR2 as a regulatory component of nuclear speckles
    (2021) Rivera Álvarez, Carlos Andrés; Verbel Vergara, Daniel Eduardo; Arancibia Radich, Duxan Andrés; Lappala, Anna; González, Marcela; Guzmán, Fabián; Merello, Gianluca; Lee, Jeannie T.; Andrés Coke, María Estela
    Background: Nuclear processes such as transcription and RNA maturation can be impacted by subnuclear compartmentalization in condensates and nuclear bodies. Here, we characterize the nature of nuclear granules formed by REST corepressor 2 (RCOR2), a nuclear protein essential for pluripotency maintenance and central nervous system development. Results: Using biochemical approaches and high-resolution microscopy, we reveal that RCOR2 is localized in nuclear speckles across multiple cell types, including neurons in the brain. RCOR2 forms complexes with nuclear speckle components such as SON, SRSF7, and SRRM2. When cells are exposed to chemical stress, RCOR2 behaves as a core component of the nuclear speckle and is stabilized by RNA. In turn, nuclear speckle morphology appears to depend on RCOR2. Specifically, RCOR2 knockdown results larger nuclear speckles, whereas overexpressing RCOR2 leads to smaller and rounder nuclear speckles. Conclusion: Our study suggests that RCOR2 is a regulatory component of the nuclear speckle bodies, setting this co-repressor protein as a factor that controls nuclear speckles behavior.