Characterization of spinal cord damage based on automatic video analysis of frog swimming

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dc.contributor.advisorMery Quiroz, Domingo
dc.contributor.authorDe Vidt Lobo, Sebastián
dc.contributor.otherPontificia Universidad Católica de Chile. Escuela de Ingeniería
dc.date.accessioned2022-10-05T17:01:36Z
dc.date.available2022-10-05T17:01:36Z
dc.date.issued2019
dc.descriptionTesis (Master of Science in Engineering)--Pontificia Universidad Católica, 2022
dc.description.abstractLa rana Xenopus laevis es un organismo utilizado para estudiar muchos aspectos de la biología moderna. Su sistema nervioso central es particularmente interesante, dado que en ciertas etapas de su metamorfosis es capaz de regenerar su médula espinal después de sufrir daño, y recuperar su capacidad de nadar. Por esto, el estudio sobre la medición automática y cuantitativa del movimiento al nadar es importante para avanzar en el entendimiento de estos mecanismos regenerativos. En esta tesis, se presenta un algoritmo capaz de caracterizar el grado de daño a la médula espinal de una rana. El método propuesto sigue la posición de una extremidad en un video de una rana, y transforma las mediciones en características cinemáticas que pueden diferenciar ranas con diferente grado de daño en la médula. El algoritmo de detección y las características cinemáticas elegidas fueron validados en un experimento de reconocimiento de patrones, en el que 90 videos divididos equitativamente en tres clases (sin daño, hemisectados y transectados) fueron clasificados en una de las tres clases mencionadas. Se obtuvo casi un 97% de precisión en el mejor resultado de lo que se puede concluir que el sistema es efectivo en la caracterización de daño a partir del análisis de un video de una rana nadando. Este método podría crear un marco de referencia para comparar recuperación de médula espinal después de aplicar diferentes tratamientos, sin la necesidad de etiquetar manualmente videos. Además, el sistema podría ser usado para medir movimiento y comportamiento en otras condiciones experimentales como estado nutricional, estrés, gen ética o edad.
dc.format.extentx, 30 páginas
dc.fuente.origenSRIA
dc.identifier.doi10.7764/tesisUC/ING/64980
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.7764/tesisUC/ING/64980
dc.identifier.urihttps://repositorio.uc.cl/handle/11534/64980
dc.information.autorucEscuela de Ingeniería ; Mery Quiroz, Domingo ; 0000-0003-4748-3882 ; 7847566
dc.information.autorucEscuela de Ingeniería ; De Vidt Lobo, Sebastián ; S/I ; 203816
dc.language.isoen
dc.nota.accesoContenido completo
dc.rightsacceso abierto
dc.subjectRanases_ES
dc.subjectTrackinges_ES
dc.subjectNadoes_ES
dc.subjectProcesamiento de videoses_ES
dc.subjectmédula espinales_ES
dc.subject.ddc620
dc.subject.deweyIngenieríaes_ES
dc.titleCharacterization of spinal cord damage based on automatic video analysis of frog swimminges_ES
dc.typetesis de maestría
sipa.codpersvinculados7847566
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